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El genoma del VPH-16 contiene dos promotores principales. El promotor P97 se encuentra rio arriba
del ORF E6 y es responsable de casi toda la expresión génica temprana (Zheng y Baker, 2006). El
promotor P670 se encuentra dentro de la región ORF E7 y es responsable de la expresión génica tardía
(Grassmann et al., 1996). Aunque se han descrito otros promotores menores en las regiones tempranas
del genoma, sus actividades sigue siendo desconocido (Zheng y Baker, 2006). El promotor VPH-16
P97, está controlado, principalmente por elementos cis, rio arriba de LCR (Zheng y Baker, 2006). E2
funciona como represor de la transcripción de P97 (Zheng y Baker, 2006), la represión transcripcional
solo se produce en células que albergan ADN de VPH-16 integrado (Bechtold, Beard y Raj, 2003).
Clasificación de genotipos
Los VPH se clasifican de acuerdo a la secuencia de nucleótidos del gen L1, la cual es altamente
conservada. Los VPH que comparten similitud de la secuencia L1 de ≥70%, pertenecen al mismo
género. El Comité Internacional de Taxonomía de Virus clasifica a los papilomavirus (PV) en 53
géneros, de los cuales solo 5 géneros incluyen PV que infectan a los humanos (VPH) (de Villiers et
al., 2004), alphapapillomavirus, beta, gamma, mu y un (Toro-Montoya y Tapia-Vela, 2023). El género
gamma incluye la mayoría de los VPH conocidos, con 99 tipos de VPH, seguidos por los géneros alpha
con 65 tipos, alphapapillomavirus que incluyen la mayoría de los VPH de alto riesgo (VPH-AR),
finalmente, beta con 54. Los géneros mu y nu incluyen solo 3 y 1 tipos, respectivamente (Gheit, 2019;
Sendagorta-cudós, Burgos-cibrián y Rodríguez-Iglesias, 2019).
Se han identificado más de 200 tipos de VPH. Los tipos de VPH se definen por diferencias de 10% a
nivel de nucleótidos (Bernard et al., 2010). Estos tipos virales se sub-clasifican de acuerdo a su riesgo
para desarrollar cáncer: VPH de alto riesgo: 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59 , 68, 73, 82;
probablemente alto riesgo: VPH 67, 30, 34, 85 y 97; de riesgo intermedio: 26, 53, y 66; bajo riesgo:
6, 11, 40,42, 43, 44, 54, 61, 70, 72 y 81 y de riesgo indeterminado: 69, 71 y 74, los genotipos de VPH
de bajo riesgo (VPH-BR) causan principalmente condilomas, y los tipos de VPH-AR, están
significativamente asociados con el desarrollo de neoplasias y cáncer (Muñoz et al., 2003; Barbieri et
al., 2012; Piña-Napal et al., 2016; Schiffman et al., 2016; Gallegos-Bolaños et al., 2017; de Sanjosé,
Brotons y Pavón, 2018; Vonsky et al., 2019).