POLIMORFISMOS EN GENES
DE HELICOBACTER PYLORI DE
PACIENTES PORTADORES EN MANIZALES
POLYMORPHISMS IN HELICOBACTER PYLORI GENES
FROM INFECTED PATIENTS IN MANIZALES
Jefferson Salguero-Sánchez
Universidad de Manizales, Colombia
pág. 6137
DOI: https://doi.org/10.37811/cl_rcm.v10i2.23623
Polimorfismos en Genes de Helicobacter Pylori de Pacientes Portadores en
Manizales
RESUMEN
Objetivo: determinar las variaciones alélicas de un grupo de pacientes portadores de Helicobacter
pylori, pudiendo estimar su riesgo para cáncer gástrico. Materiales y Métodos: Se utilizaron pruebas
moleculares para la extracción de ADN al igual que reacción en cadena de la polimerasa y electroforesis
para la amplificación. Resultados: Se logro amplificar e identificar los genes para las proteínas CagA y
VacA aunque no fue posible determinar los polimorfismos presentes en estos. Se recomienda el uso de
estas pruebas como estudios complementarios para estimar el riesgo oncogénico.
Palabras clave: polimorfismo genético; cáncer gástrico; helicobacter pylori; proteína VacA; proteína
CagA
1 Autor principal.
Correspondencia: salguero0515@hotmail.com
Jefferson Salguero-Sánchez 1
salguero0515@hotmail.com
https://orcid.org/0000-0003-4170-2618
Universidad de Manizales
Colombia
DOI: https://doi.org/10.37811/cl_rcm.v10i2.23623
Polimorfismos en Genes de Helicobacter Pylori de Pacientes Portadores en
Manizales
RESUMEN
Objetivo: determinar las variaciones alélicas de un grupo de pacientes portadores de Helicobacter
pylori, pudiendo estimar su riesgo para cáncer gástrico. Materiales y Métodos: Se utilizaron pruebas
moleculares para la extracción de ADN al igual que reacción en cadena de la polimerasa y electroforesis
para la amplificación. Resultados: Se logro amplificar e identificar los genes para las proteínas CagA y
VacA aunque no fue posible determinar los polimorfismos presentes en estos. Se recomienda el uso de
estas pruebas como estudios complementarios para estimar el riesgo oncogénico.
Palabras clave: polimorfismo genético; cáncer gástrico; helicobacter pylori; proteína VacA; proteína
CagA
1 Autor principal.
Correspondencia: salguero0515@hotmail.com
Jefferson Salguero-Sánchez 1
salguero0515@hotmail.com
https://orcid.org/0000-0003-4170-2618
Universidad de Manizales
Colombia
pág. 6138
Polymorphisms in Helicobacter Pylori Genes From Infected Patients in
Manizales
ABSTRACT
Objective: to determine the allelic variations of a group of patients carrying Helicobacter pylori, being
able to estimate their risk for gastric cancer. Materials and Methods: Molecular tests were used for the
extraction of DNA as well as reaction in the polymerase chain and electrophoresis for the amplification.
Results: It was possible to amplify and identify the genes for the CagA and VacA proteins, although it
wasn’t determined the polymorphisms present in them. The use of these tests is recommended as
complementary studies to estimate the oncogenic risk.
Keywords: genetic polymorphisms; stomach neoplasms; helicobacter pylori; VacA protein; CagA
protein
Artículo recibido 28 febrero 2026
Aceptado para publicación: 28 marzo 2026
Polymorphisms in Helicobacter Pylori Genes From Infected Patients in
Manizales
ABSTRACT
Objective: to determine the allelic variations of a group of patients carrying Helicobacter pylori, being
able to estimate their risk for gastric cancer. Materials and Methods: Molecular tests were used for the
extraction of DNA as well as reaction in the polymerase chain and electrophoresis for the amplification.
Results: It was possible to amplify and identify the genes for the CagA and VacA proteins, although it
wasn’t determined the polymorphisms present in them. The use of these tests is recommended as
complementary studies to estimate the oncogenic risk.
Keywords: genetic polymorphisms; stomach neoplasms; helicobacter pylori; VacA protein; CagA
protein
Artículo recibido 28 febrero 2026
Aceptado para publicación: 28 marzo 2026
pág. 6139
INTRODUCCIÓN
El cáncer como enfermedad ha tomado gran importancia como problema de salud pública creciente
debido a su impacto, altos costos y letalidad. Dentro de este grupo, es de destacar los de origen
gastrointestinal, los cuales alcanzan primeros lugares a nivel mundial y local tanto en incidencia como
mortalidad, siendo el cáncer gástrico el quinto más común, aportando Sudamérica el 7% de la carga
mundial (1), además de representar la tercera causa de muerte por cáncer tanto en hombres como
mujeres. (2, 3)
Existen múltiples factores de riesgo para cáncer como lo son la edad, inadecuados estilos de vida, dieta
e infecciones. De estas últimas se destaca la infección por la bacteria del género Helicobacter y su
especie pylori, la cual se ha identificado como uno de los principales agentes etiológicos, aunque esta
por si sola no es suficiente ya que aproximadamente el 2% de los pacientes evolución a cáncer gástrico
(4).
Con respecto a esta bacteria es de destacar sus características propias que la diferencian del resto, como
su forma espiral o bacilar y su alta movilidad dada por múltiples flagelos polares, entre otras.
Igualmente, se tiene que la presencia de lipopolisacáridos en su membrana externa, la protege de la
eliminación inmunitaria debido a que esta cadena a nivel antigénico es similar al grupo sanguíneo de
Lewis. Con respecto a la virulencia y toxigenicidad de este microorganismo se encuentra que presenta
una citotoxina (VacA), proteína que causa lesiones celulares mediante la formación de vacuolas, y un
gen A asociado a citotoxina (CagA), el cual codifica a nivel de las células epiteliales interfiriendo con
la estructura del citoesqueleto, además de inducir producción de interleucina 8 (4, 5). Es claro entonces
que todos los Helicobacter pylori son patógenos y por tanto las alteraciones celulares provocadas
conducen a gastritis crónicas, las cuales pueden presentarse con diferentes patrones, un fenotipo de
úlcera duodenal caracterizado por una gastritis antral con un menor riesgo oncogénico, un fenotipo de
gastritis crónica no atrófica y un fenotipo cáncer gástrico caracterizado por gastritis crónica atrófica
multifocal, siendo este el de mayor riesgo. Estos estómagos afectados por Helicobacter sufren diferentes
mecanismos indirectos y directos en vía a la carcinogénesis. Entre los indirectos se destaca la respuesta
inmune tanto innata como adquirida y los directos corresponden a las acciones de los factores de
virulencia del microorganismo: CagA y VacA (6).
INTRODUCCIÓN
El cáncer como enfermedad ha tomado gran importancia como problema de salud pública creciente
debido a su impacto, altos costos y letalidad. Dentro de este grupo, es de destacar los de origen
gastrointestinal, los cuales alcanzan primeros lugares a nivel mundial y local tanto en incidencia como
mortalidad, siendo el cáncer gástrico el quinto más común, aportando Sudamérica el 7% de la carga
mundial (1), además de representar la tercera causa de muerte por cáncer tanto en hombres como
mujeres. (2, 3)
Existen múltiples factores de riesgo para cáncer como lo son la edad, inadecuados estilos de vida, dieta
e infecciones. De estas últimas se destaca la infección por la bacteria del género Helicobacter y su
especie pylori, la cual se ha identificado como uno de los principales agentes etiológicos, aunque esta
por si sola no es suficiente ya que aproximadamente el 2% de los pacientes evolución a cáncer gástrico
(4).
Con respecto a esta bacteria es de destacar sus características propias que la diferencian del resto, como
su forma espiral o bacilar y su alta movilidad dada por múltiples flagelos polares, entre otras.
Igualmente, se tiene que la presencia de lipopolisacáridos en su membrana externa, la protege de la
eliminación inmunitaria debido a que esta cadena a nivel antigénico es similar al grupo sanguíneo de
Lewis. Con respecto a la virulencia y toxigenicidad de este microorganismo se encuentra que presenta
una citotoxina (VacA), proteína que causa lesiones celulares mediante la formación de vacuolas, y un
gen A asociado a citotoxina (CagA), el cual codifica a nivel de las células epiteliales interfiriendo con
la estructura del citoesqueleto, además de inducir producción de interleucina 8 (4, 5). Es claro entonces
que todos los Helicobacter pylori son patógenos y por tanto las alteraciones celulares provocadas
conducen a gastritis crónicas, las cuales pueden presentarse con diferentes patrones, un fenotipo de
úlcera duodenal caracterizado por una gastritis antral con un menor riesgo oncogénico, un fenotipo de
gastritis crónica no atrófica y un fenotipo cáncer gástrico caracterizado por gastritis crónica atrófica
multifocal, siendo este el de mayor riesgo. Estos estómagos afectados por Helicobacter sufren diferentes
mecanismos indirectos y directos en vía a la carcinogénesis. Entre los indirectos se destaca la respuesta
inmune tanto innata como adquirida y los directos corresponden a las acciones de los factores de
virulencia del microorganismo: CagA y VacA (6).
pág. 6140
El gen asociado a la citotoxina (CagA) es el encargado de codificar la proteína CagA, la cual esta
presente en un 60% de los Helicobacter pylori de países occidentales (7). Esta proteína es altamente
inmunogénica, induciendo una alta producción de interleucina 8, mayor proliferación celular y
apoptosis. La traslocación de esta proteína a la célula epitelial es reconocida como una molécula de
señalización y de forma igual a otras moléculas es fosforilada, generando activación de la tirosin
fosfatasas SHP-2, una oncoproteína, cuya mutación esta asociada a procesos malignos (8).
Independientemente de este proceso esta proteína tiene la capacidad de dañar la interacción celular,
destruyendo las uniones estrechas de estas y causando alteración de la polaridad. CagA en estudios
experimentales demostró ser una verdadera oncoproteína debido a su actividad, incluso al ser inhibida
la capacidad de fosforilarse (9).
El gen VacA codifica la citotoxina vacuolizante o proteína VacA, a diferencia de CagA todos los
Helicobacter pylori poseen este gen, la diferencia radica en la expresión funcional, por lo que no todas
las cepas generan vacuolización masiva de las células epiteliales. Esta proteína presenta varios
polimorfismos considerado en dos regiones cada una con dos variaciones alélicas (s1 o s2
correspondientes a la secuencia señal; y m1 o m2 correspondiente a la región media del genoma) las
cuales pueden presentarse en cualquier combinación, las cuales pueden inhibir la actividad vacuolizante
(s2) o aumentar la citotoxicidad celular (s1) (10). Por ejemplo las cepas VacA s1m1 esta relacionada
con gastritis severa y atrófica, metaplasia intestinal, úlceras y cáncer gástrico; mientras las VacA s2m2
producen escasa actividad citotóxica, generando gastritis leve y menor riesgo de cáncer gástrico (11).
Con lo expuesto anteriormente, el objetivo fue determinar las variaciones alélicas de un grupo de
pacientes portadores de Helicobacter pylori, para estimar su riesgo específico a cáncer gástrico.
METODOLOGÍA
La extracción de material se realizó a partir de muestras de cuerpo y antro gástrico a través de
endoscopia digestiva alta de pacientes infectados por Helicobacter pylori. El primer paso fue la
amplificación para luego se proceder a la realización de la reacción en cadena de la polimerasa, la cual
se constituyo en 12,5 uL (7,65 uL H2O, 1,25 uL Buffer Taq 10x, 1 uL de MgCl2, 1 uL de dNTP, 0,5 uL
de Primer F, 0,5 uL de Primer R, 0,1 uL de Taq Polimerasa y 0,5 uL de ADN). El protocolo del
termociclador constó de un paso inicial a 94°C durante tres minutos seguido de 35 ciclos (primera fase:
El gen asociado a la citotoxina (CagA) es el encargado de codificar la proteína CagA, la cual esta
presente en un 60% de los Helicobacter pylori de países occidentales (7). Esta proteína es altamente
inmunogénica, induciendo una alta producción de interleucina 8, mayor proliferación celular y
apoptosis. La traslocación de esta proteína a la célula epitelial es reconocida como una molécula de
señalización y de forma igual a otras moléculas es fosforilada, generando activación de la tirosin
fosfatasas SHP-2, una oncoproteína, cuya mutación esta asociada a procesos malignos (8).
Independientemente de este proceso esta proteína tiene la capacidad de dañar la interacción celular,
destruyendo las uniones estrechas de estas y causando alteración de la polaridad. CagA en estudios
experimentales demostró ser una verdadera oncoproteína debido a su actividad, incluso al ser inhibida
la capacidad de fosforilarse (9).
El gen VacA codifica la citotoxina vacuolizante o proteína VacA, a diferencia de CagA todos los
Helicobacter pylori poseen este gen, la diferencia radica en la expresión funcional, por lo que no todas
las cepas generan vacuolización masiva de las células epiteliales. Esta proteína presenta varios
polimorfismos considerado en dos regiones cada una con dos variaciones alélicas (s1 o s2
correspondientes a la secuencia señal; y m1 o m2 correspondiente a la región media del genoma) las
cuales pueden presentarse en cualquier combinación, las cuales pueden inhibir la actividad vacuolizante
(s2) o aumentar la citotoxicidad celular (s1) (10). Por ejemplo las cepas VacA s1m1 esta relacionada
con gastritis severa y atrófica, metaplasia intestinal, úlceras y cáncer gástrico; mientras las VacA s2m2
producen escasa actividad citotóxica, generando gastritis leve y menor riesgo de cáncer gástrico (11).
Con lo expuesto anteriormente, el objetivo fue determinar las variaciones alélicas de un grupo de
pacientes portadores de Helicobacter pylori, para estimar su riesgo específico a cáncer gástrico.
METODOLOGÍA
La extracción de material se realizó a partir de muestras de cuerpo y antro gástrico a través de
endoscopia digestiva alta de pacientes infectados por Helicobacter pylori. El primer paso fue la
amplificación para luego se proceder a la realización de la reacción en cadena de la polimerasa, la cual
se constituyo en 12,5 uL (7,65 uL H2O, 1,25 uL Buffer Taq 10x, 1 uL de MgCl2, 1 uL de dNTP, 0,5 uL
de Primer F, 0,5 uL de Primer R, 0,1 uL de Taq Polimerasa y 0,5 uL de ADN). El protocolo del
termociclador constó de un paso inicial a 94°C durante tres minutos seguido de 35 ciclos (primera fase:
pág. 6141
desnaturalización a 94°C durante 20 segundos, segunda fase: hibridación a 50°C durante 20 segundos,
y tercera fase: extensión a 72°C durante 20 segundos) con pase final a 72 °C durante cinco minutos.
Una vez hecho lo anterior, se procedió a la verificación mediante electroforesis (se realizó mediante
TAE 1X y agarosa, siendo el buffer de corrida una dilución de buffer TAE 50X con agua destilada
estéril). Se sirvió la mezcla y en cada pozo se colocó un buffer de carga y Gel Red (proporción 1000:1).
Se corrió el gel a una corriente eléctrica de 75 V durante una hora y se llevó a luz ultravioleta.
RESULTADOS Y DISCUSIÓN
De las muestras correspondientes en el estudio, se lograron amplificar todas las muestras esto mediante
el uso de técnicas moleculares como la reacción en cadena de la polimerasa. Utilizando herramientas
de bioinformática universales, como el BLAST en el servidor del National Center for Biotechnology
Information (NCBI, por sus siglas en inglés) se logro tipificar las secuencias aisladas en el laboratorio,
esto gracias a las diferentes variantes de búsqueda, para este caso se utilizó NBLAST debido a que
nuestras secuencias correspondían a cadenas de nucleótidos; en la primera muestra determino una
alineación completa (100%) con 95 secuencias y un 99% con 10 más idénticas al gen para proteína A
asociada a citotoxina (CagA) de Helicobacter pylori siendo el primero el secuenciado por Suzuki et al
en el 2016 (GenBank Acceso LC185374) (12) La segunda muestra reporto una alineación del 98% con
100 secuencias idénticas al gen para la citotoxina vacuolizante A (VacA) de H. pylori siendo la de
mayor cobertura la secuenciada por Ito et al en 1998. (GenBank Acceso AF049641) (13). Y una tercera
muestra que evidencio una alineación del 98% en 99 secuencias idénticas también al gen de VacA
siendo la primera y de mayor cobertura la secuenciada por Suzuki en el mismo estudio antes
mencionado (12).
La presencia de estos genes nos sugiere varias afirmaciones, la presencia de CagA+ y VacA confirma
la infección por Helicobacter pylori en las muestras y la evidencia de factores de riesgo oncogénico
(14). Aunque no fue posible determinar los polimorfismos de los genes secuenciados en la muestra, se
observa en literatura que los subtipos VacA dominantes en Asia son s1c, m2a y m1 (15), variaciones
asociadas a mayor citotoxicidad y por ende mayor riesgo oncogénico. La presencia de múltiples alelos
de VacA s o m sugiere infección múltiple, circunstancia que resulta relevante al ser esto más común en
Portugal y Sur América (16-18).
desnaturalización a 94°C durante 20 segundos, segunda fase: hibridación a 50°C durante 20 segundos,
y tercera fase: extensión a 72°C durante 20 segundos) con pase final a 72 °C durante cinco minutos.
Una vez hecho lo anterior, se procedió a la verificación mediante electroforesis (se realizó mediante
TAE 1X y agarosa, siendo el buffer de corrida una dilución de buffer TAE 50X con agua destilada
estéril). Se sirvió la mezcla y en cada pozo se colocó un buffer de carga y Gel Red (proporción 1000:1).
Se corrió el gel a una corriente eléctrica de 75 V durante una hora y se llevó a luz ultravioleta.
RESULTADOS Y DISCUSIÓN
De las muestras correspondientes en el estudio, se lograron amplificar todas las muestras esto mediante
el uso de técnicas moleculares como la reacción en cadena de la polimerasa. Utilizando herramientas
de bioinformática universales, como el BLAST en el servidor del National Center for Biotechnology
Information (NCBI, por sus siglas en inglés) se logro tipificar las secuencias aisladas en el laboratorio,
esto gracias a las diferentes variantes de búsqueda, para este caso se utilizó NBLAST debido a que
nuestras secuencias correspondían a cadenas de nucleótidos; en la primera muestra determino una
alineación completa (100%) con 95 secuencias y un 99% con 10 más idénticas al gen para proteína A
asociada a citotoxina (CagA) de Helicobacter pylori siendo el primero el secuenciado por Suzuki et al
en el 2016 (GenBank Acceso LC185374) (12) La segunda muestra reporto una alineación del 98% con
100 secuencias idénticas al gen para la citotoxina vacuolizante A (VacA) de H. pylori siendo la de
mayor cobertura la secuenciada por Ito et al en 1998. (GenBank Acceso AF049641) (13). Y una tercera
muestra que evidencio una alineación del 98% en 99 secuencias idénticas también al gen de VacA
siendo la primera y de mayor cobertura la secuenciada por Suzuki en el mismo estudio antes
mencionado (12).
La presencia de estos genes nos sugiere varias afirmaciones, la presencia de CagA+ y VacA confirma
la infección por Helicobacter pylori en las muestras y la evidencia de factores de riesgo oncogénico
(14). Aunque no fue posible determinar los polimorfismos de los genes secuenciados en la muestra, se
observa en literatura que los subtipos VacA dominantes en Asia son s1c, m2a y m1 (15), variaciones
asociadas a mayor citotoxicidad y por ende mayor riesgo oncogénico. La presencia de múltiples alelos
de VacA s o m sugiere infección múltiple, circunstancia que resulta relevante al ser esto más común en
Portugal y Sur América (16-18).
pág. 6142
En Colombia, el estudio realizado en el Instituto Nacional de Cancerología que comparaba una
población de alto riesgo contra una de riesgo opuesto demostró una mayor distribución de factores de
virulencia en pacientes de sexo masculino y con respecto a los genes reporto que CagA+ estaba presente
en más de la mitad de pacientes de alto y bajo riesgo, y con relación a las variantes de VacA se
documentó una distribución mayor de s1, m1 y en combinación s1m1 con respecto a sus opuestos en
ambas poblaciones de riesgo (19). Lo anterior puede ser explicado por el hecho de que la presencia de
este microorganismo no es el único origen etiológico, esto sumado a las condiciones medioambientales
y polimorfismos genéticos propios de cada paciente que pueden llegar a ser influyentes interviniendo
así en la aparición de la enfermedad. Igualmente es necesario tener en cuenta que estas dos proteínas
no son los únicos factores de virulencia, encontramos otras como el oipA, BabA, alpAB y CagE, los
cuales no son infrecuentes en nuestra población e incluso pudieran estar asociados a lesiones más
severas (20-22).
CONCLUSIONES
Mediante este trabajo no sólo se pretende evidenciar el avance de las pruebas moleculares sino también
permitir establecer el riesgo oncogénico de una cepa bacteriana en un paciente, mediante la
determinación de los diferentes polimorfismos. Debido a que la identificación de polimorfismos de
Helicobacter pylori en muestras de pacientes infectados permite estimar de forma complementaria el
riesgo de progresión de una lesión. Como limitante se tiene que el número de muestras fue limitado y
que a pesar de una alineación idéntica con otras cadenas ya procesadas no es posible determinar el tipo
de polimorfismo presentes en nuestra población.
REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS
1. Carcas LP. Gastric cáncer review. J Carcinog 2014;19: 13-4.
2. Karimi P et al. Gastric cancer: descriptive epidemiology, risk factors, screening, and prevention.
Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2014;23(5): 700-13.
3. Burucoa C. Epidemiology of Helicobacter pylori infection. Helicobacter 2017;22(S1):1-5.
4. Otero RW, Gómez MA, Castro D. Carcinogénesis gástrica. Rev Col Gastroenterol 2009;24(3):314-
39.
En Colombia, el estudio realizado en el Instituto Nacional de Cancerología que comparaba una
población de alto riesgo contra una de riesgo opuesto demostró una mayor distribución de factores de
virulencia en pacientes de sexo masculino y con respecto a los genes reporto que CagA+ estaba presente
en más de la mitad de pacientes de alto y bajo riesgo, y con relación a las variantes de VacA se
documentó una distribución mayor de s1, m1 y en combinación s1m1 con respecto a sus opuestos en
ambas poblaciones de riesgo (19). Lo anterior puede ser explicado por el hecho de que la presencia de
este microorganismo no es el único origen etiológico, esto sumado a las condiciones medioambientales
y polimorfismos genéticos propios de cada paciente que pueden llegar a ser influyentes interviniendo
así en la aparición de la enfermedad. Igualmente es necesario tener en cuenta que estas dos proteínas
no son los únicos factores de virulencia, encontramos otras como el oipA, BabA, alpAB y CagE, los
cuales no son infrecuentes en nuestra población e incluso pudieran estar asociados a lesiones más
severas (20-22).
CONCLUSIONES
Mediante este trabajo no sólo se pretende evidenciar el avance de las pruebas moleculares sino también
permitir establecer el riesgo oncogénico de una cepa bacteriana en un paciente, mediante la
determinación de los diferentes polimorfismos. Debido a que la identificación de polimorfismos de
Helicobacter pylori en muestras de pacientes infectados permite estimar de forma complementaria el
riesgo de progresión de una lesión. Como limitante se tiene que el número de muestras fue limitado y
que a pesar de una alineación idéntica con otras cadenas ya procesadas no es posible determinar el tipo
de polimorfismo presentes en nuestra población.
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four Helicobacter pylori isolates. Gene 2004;17(328):85-93.
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Helicobacter pylori determines cytotoxin activity. J Bacteriol 2000;182:3278-80.
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