Inhibición de la Sirtuina 6 (SIRT6) por Antocianinas del Maíz Morado (Zea mays): Un Estudio Comparativo de Afinidad Mediante Optimización Cuántica DFT y Docking Molecular
Resumen
En el presente estudio se evaluó, mediante herramientas de química computacional, la interacción entre tres antocianinas; cianidina-3-O-glucósido; peonidina y pelargonidina, y, la enzima SIRT6, un blanco terapéutico relevante en procesos asociados al envejecimiento y la regulación metabólica. Las propiedades electrónicas de los compuestos fueron analizadas utilizando la Teoría del Funcional de la Densidad (DFT) a nivel B3LYP/6-31G(d), permitiendo determinar parámetros de reactividad como energías de los orbitales HOMO–LUMO, brecha energética (ΔE) y dureza química (η). Los resultados indican que la peonidina presenta la menor brecha energética (ΔE = 2.7864 eV), lo que sugiere una mayor polarizabilidad y capacidad de interacción electrónica. Los estudios de acoplamiento molecular realizados mediante SwissDock evidenciaron que la pelargonidina exhibe la mayor afinidad de unión (ΔG = −7.228 kcal/mol), seguida de la peonidina (ΔG = −7.081 kcal/mol), mientras que la cianidina mostró una interacción menos favorable. El análisis estructural evidenció interacciones clave con Ala51 y Gln216, incluyendo enlaces de hidrógeno cortos y anclaje bidentado. La afinidad de unión depende tanto de la reactividad molecular como de la complementariedad geométrica con el sitio activo. Se observó un impedimento estérico en el sitio de unión del NAD⁺, lo que respalda un posible mecanismo de inhibición competitiva. En conjunto, estos hallazgos proporcionan una base teórica para el diseño de moduladores de SIRT6 derivados de antocianinas y destacan la importancia de combinar métodos de DFT y docking molecular para el estudio de interacciones proteína–ligando.
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